10 августа 1942 года немецко-фашистскими войсками был оккупирован г. Минеральные Воды. Здесь было расстреляно и замучено 10 тысяч советских людей. В этот же день в 1994 году Ставропольской городской думой утвержден современный герб города Ставрополя. Его авторы — Николай Анатольевич Охонько и Ирина Петровна Олейник.
Пять месяцев страха — именно так жители города и района охарактеризовали период оккупации, когда территория была под контролем фашистских войск. Немцы были крайне недовольны мрачными лицами местных жителей и боялись партизанской активности. В центре города на видных местах были размещены объявления с жёстким предупреждением: "Если будет убит немецкий солдат, то 100 жителей города будут немедленно расстреляны". В здании железнодорожного вокзала располагалась немецкая комендатура, откуда регулярно вывозили подозреваемых советских граждан, подвергая их жестоким допросам и пыткам. Гестапо переполнялось заключёнными — советскими патриотами.
В здании школы №1 был устроен немецкий госпиталь. В музее железнодорожного отделения сохранились многочисленные свидетельства очевидцев, переживших оккупацию.
Затем город подвергся бомбардировкам со стороны советской авиации. Среди пилотов был уроженец Минеральных Вод — летчик ночной бомбардировочной авиации И. Я. Митенко, который не скрывал, что бомбить родной город для него было тяжёлым испытанием. Он понимал, что может пострадать его семья, но осознавал важность задачи — разрушить железнодорожные составы, снабжавшие врага боеприпасами и живой силой.
К декабрю 1942 года части Кавказского фронта готовились к наступлению. Основной задачей была защита железнодорожного узла Минеральные Воды и предотвращение вывоза противником техники и ресурсов. 14 декабря в район горы Змейки с самолёта была высажена разведывательно-диверсионная группа "Месть", но из-за предательства вскоре все участники операции были захвачены. Их подвергли жестоким пыткам, затем перевезли в тюрьму Пятигорска и в ночь на Новый 1943 год расстреляли в лесу у подножия Машука. На западном склоне горы Змейки сейчас установлена стела в память о подвиге разведчиков.
1 января 1943 года войска Закавказского фронта начали освобождение Кавказа от оккупантов. Уже 3 января советские части заняли Моздок и Малгобек, а 5 января вышли к Прохладному.
11 января 1943 года танковые и стрелковые подразделения прорвались к восточным окраинам Минеральных Вод, где разгорелся бой. Под командованием капитана Петрова танковый батальон атаковал железнодорожную станцию и уничтожил вражеские эшелоны. Главные силы 52-й танковой бригады установили заслоны на северо-востоке и юге города. Разгорелись ожесточённые уличные бои, особенно на станции, где находились основные силы противника. В результате пожара горели вагоны и цистерны с горючим. К вечеру 11 января город был полностью освобождён от немецких захватчиков благодаря совместным усилиям 58-й и 9-й армий.